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thermo賽默飛Simpliamp梯度PCR儀做實(shí)驗(yàn)時(shí)使用哪些耗材和試劑?

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使用賽默飛Simpliamp梯度PCR儀進(jìn)行實(shí)驗(yàn)時(shí)所需的耗材和試劑。這是一套標(biāo)準(zhǔn)而完整的清單,您可以根據(jù)您的具體實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行選擇和調(diào)整。


一、賽默飛Simpliamp梯度PCR儀核心耗材

這些是直接放入PCR儀的消耗品。

1、PCR管或PCR板

(1)類型:必須使用透明、無裙邊或半裙邊的96孔PCR板或0.2ml單管/8聯(lián)管。Simpliamp的熱蓋是平板式設(shè)計(jì),與平蓋的板/管才能緊密接觸,確保熱封效果。

(2)材質(zhì):推薦使用高質(zhì)量、超薄壁的聚丙烯管/板,以確保熱傳導(dǎo)效率和溫度準(zhǔn)確性。

(3)重要提示:切勿使用有高高凸起管蓋的PCR管(如某些品牌的單管),否則熱蓋無法壓緊,會導(dǎo)致反應(yīng)體系蒸發(fā)和實(shí)驗(yàn)失敗。

2、封板膜或管蓋

(1)對于PCR板:使用光學(xué)透明的粘性封板膜,確保密封嚴(yán)實(shí),防止蒸發(fā)和交叉污染。

(2)對于單管/八聯(lián)管:確保管蓋蓋緊。八聯(lián)管通常有配套的平蓋。


二、賽默飛Simpliamp梯度PCR儀核心試劑

這些是構(gòu)成PCR反應(yīng)體系的化學(xué)成分。

1、PCR主混合物

(1)預(yù)混液:常用且方便的是 2× PCR Master Mix。它已經(jīng)包含了Taq DNA聚合酶、dNTPs、MgCl?以及優(yōu)化的緩沖液。您只需加入模板、引物和水即可。賽默飛自家的 Platinum™ SuperFi™ PCR Master Mix 或 DreamTaq™ Hot Start PCR Master Mix 都是兼容性很好的選擇。

(2)單獨(dú)組分:也可以選擇單獨(dú)購買:熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶、10× PCR緩沖液、dNTP混合物、MgCl?溶液。

2、引物

上游引物和下游引物:針對您目標(biāo)基因特異性設(shè)計(jì)的寡核苷酸引物。通常使用濃度為10 μM的工作液。

3、模板DNA

可以是基因組DNA、cDNA、質(zhì)粒DNA等,濃度和純度需根據(jù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化。

4、無菌無核酸酶水

用于補(bǔ)足反應(yīng)體系體積。至關(guān)重要,必須確保無菌且無核酸酶污染,以防止降解和假陰性結(jié)果。


三、實(shí)驗(yàn)流程簡要總結(jié)(以使用預(yù)混液為例)

1、在冰上配制反應(yīng)體系(以下為25μL體系的常見比例):

2× PCR Master Mix:12.5 μL

上游引物(10 μM):1.0 μL

下游引物(10 μM):1.0 μL

模板DNA:X μL(通常10pg - 100ng,需優(yōu)化)

無菌無核酸酶水:補(bǔ)足至 25 μL

2、輕柔混勻并短暫離心,確保所有液體收集在管底。

3、將PCR管/板放入Simpliamp儀器中,確保放置平穩(wěn)。

4、在儀器控制面板或配套軟件上設(shè)置程序:

預(yù)變性:94-98°C,30秒 - 2分鐘。

循環(huán)(30-40次):

變性:94-98°C,10-30秒。

退火:在此設(shè)置梯度溫度(例如50°C - 65°C),這是Simpliamp梯度功能的關(guān)鍵應(yīng)用,用于快速確定退火溫度。15-60秒。

延伸:72°C(對于Taq酶),每1kb延伸30-60秒。5-10分鐘。保溫:4-10°C。

5、啟動(dòng)運(yùn)行。

6、程序結(jié)束后,取出產(chǎn)物,進(jìn)行后續(xù)的電泳或分析。


梯度功能:Simpliamp的核心優(yōu)勢是可以在同一塊板/同一批管子上同時(shí)測試多個(gè)退火溫度。在設(shè)置時(shí),您只需要在退火步驟設(shè)置一個(gè)溫度范圍,儀器會自動(dòng)在加熱塊的不同列生成線性梯度。放置樣品時(shí),請根據(jù)儀器說明書或屏幕提示,將樣品放在對應(yīng)的列上。


清潔與維護(hù):定期用70%乙醇擦拭熱蓋和樣品槽,防止污染。

TEL:18016231680

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