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技術(shù)文章

biorad伯樂CFX Opus96實時熒光定量PCR儀正確操作使用方法

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伯樂Bio-Rad CFX Opus 96實時熒光定量PCR儀的正確操作使用方法。這是一份詳細的、分步驟的操作指南,旨在幫助您安全、準確、高效地使用該儀器。


一、伯樂CX OPUS96實時熒光定量PCR儀實驗前準備

1、儀器準備

開機:打開儀器主機電源,再打開電腦。啟動 CFX Maestro 軟件。儀器會進行自檢,確保所有指示燈正常。

預(yù)熱:儀器開機后預(yù)熱10-15分鐘,使光學(xué)系統(tǒng)和加熱模塊穩(wěn)定。

2、軟件準備

在電腦上雙擊打開 CFX Maestro 軟件。

創(chuàng)建新實驗:點擊 New Experiment 或 Create Experiment。

3、實驗設(shè)計

明確您的實驗?zāi)康模憾?、相對定量(基因表達分析)、基因分型等。

設(shè)計好您的實驗布局(板布局),包括:

待測樣品:每個樣品設(shè)置技術(shù)重復(fù)(通常2-3個)。

標準品(用于定量):一系列已知濃度的DNA/cDNA,用于生成標準曲線。

陰性對照:

無模板對照:反應(yīng)體系中不加任何模板,用于檢測試劑或環(huán)境是否存在污染。

無逆轉(zhuǎn)錄對照:僅用于基因表達分析,檢測基因組DNA污染。

內(nèi)參基因(用于相對定量):用于校正樣品間的加樣量和RNA質(zhì)量差異。

4、反應(yīng)體系配制(在冰上或冷卻板上操作)

根據(jù)您的試劑盒說明書或自行優(yōu)化的方案,計算并配制 主混合液。

推薦配制順序:在一個1.5 mL無菌無核酸酶離心管中,按以下順序加入:

無核酸酶水

PCR緩沖液、Mg2?等

dNTPs

引物 和 探針(如使用)

熱啟動DNA聚合酶(最后加入,避免室溫下非特異性擴增)

充分混勻并短暫離心。

將主混合液分裝到PCR板或八聯(lián)管中。

最后在指定的模板添加區(qū)加入模板DNA/cDNA,蓋上管蓋/板膜。

短暫離心PCR板/八聯(lián)管,確保所有液體沉于管底且無氣泡。


二、伯樂CFX OPUS96實時熒光定量PCR儀上機操作流程

1、步驟1:放置樣品

打開儀器的樣品槽門。

如果是96孔板:將其平穩(wěn)地放入樣品槽中,確保板子放置平整,A1孔位于左上角。

如果是八聯(lián)管:確保所有管子擺放整齊,卡在支架上,位置正確。

輕柔地關(guān)上樣品槽門。

2、步驟2:在CFX Maestro軟件中設(shè)置實驗

(1)選擇檢測類型:

點擊 Assay -> Select。

對于SYBR Green I染料:選擇 SYBR® Green。

對于TaqMan探針:選擇 FAM 或其他相應(yīng)的熒光染料。

對于HRM分析:選擇 HRM。

(2)設(shè)置板布局:

在虛擬的96孔板界面上,用鼠標拖動選擇孔位。

為選中的孔位指定 樣品名稱 和 任務(wù)。

任務(wù)類型包括:

Unknown:未知樣品。

Standard:標準品,并需要輸入其濃度。

NTC:無模板對照。

Positive Control:陽性對照。

(3)編輯實驗協(xié)議:

點擊 Protocol 進入編輯界面。一個典型的qPCR程序包括三個階段:

a. 預(yù)變性/熱啟動:

溫度:95°C

時間:2-5分鐘(根據(jù)酶的要求,激活熱啟動酶并確保模板變性)。

b. 擴增循環(huán)(重復(fù)40-45個循環(huán)):

變性:95°C,10-30秒。

退火/延伸:60°C(常用),30-60秒。在此步驟采集熒光信號。

注意:如果引物Tm值較低,可能需要分開設(shè)置退火和延伸步驟。

c. 熔解曲線分析(僅適用于SYBR Green I):

儀器會自動生成一個標準熔解曲線程序,通常為:

95°C,10秒

65°C,5秒

然后從65°C緩慢升溫到95°C,每0.5°C采集一次熒光信號。

3、步驟3:啟動運行

保存實驗文件:為您的實驗命名并保存(.pcrd 文件)。

點擊 Start Run。

軟件會彈出一個對話框,讓您再次確認板布局和實驗協(xié)議。確認無誤后,點擊 開始。

儀器將開始運行,您可以在軟件界面上實時查看反應(yīng)進程、擴增曲線和溫度狀態(tài)。


三、伯樂CFX OPUS96實時熒光定量PCR儀運行后數(shù)據(jù)分析

1、查看擴增曲線:

確保所有陽性樣品的擴增曲線呈標準的“S"型,基線平穩(wěn),指數(shù)期明顯。

檢查NTC對照是否有擴增信號(應(yīng)無或Ct值>35),如有則表明存在污染。

2、查看熔解曲線(SYBR Green I):

確保每個樣品只有一個單一的、尖銳的峰。出現(xiàn)多個峰或?qū)挿灞砻饔幸锒垠w或非特異性擴增。

3、進行定量分析:

定量:軟件會根據(jù)標準品自動生成標準曲線(R2 > 0.99,效率在90%-110%之間為佳),并計算出未知樣品的起始拷貝數(shù)或濃度。

相對定量(ΔΔCt法):

軟件會先計算每個樣品的內(nèi)參基因(管家基因)和目標基因的Ct值。

然后通過 ΔCt = Ct(目標基因) - Ct(內(nèi)參基因),ΔΔCt = ΔCt(實驗組) - ΔΔCt(對照組),最終計算出 2^(-ΔΔCt),即基因表達的相對倍數(shù)變化。

4、導(dǎo)出數(shù)據(jù):可以將圖表和數(shù)據(jù)(如Ct值、濃度等)導(dǎo)出為Excel或PDF格式,用于報告和存檔。

TEL:18016231680

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