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Bio-Rad伯樂T100梯度PCR儀器的詳細操作使用指南。無論您是初學(xué)者還是需要復(fù)習(xí),按照以下步驟都能安全、準(zhǔn)確地完成實驗。
一、伯樂T100梯度PCR系統(tǒng)創(chuàng)建和運行程序
T100的界面非常直觀,主要通過旋鈕和按鈕進行操作。屏幕會顯示清晰的菜單。
1、步驟1:創(chuàng)建新程序或選擇已有程序
新程序: 在主菜單,轉(zhuǎn)動旋鈕選擇 “New Protocol" ,然后按旋鈕確認。
已有程序: 選擇 “Saved Protocols",從列表中找到您之前保存的程序,按“Run"運行。
2、步驟2:設(shè)置溫度與時間(程序核心)
一個標(biāo)準(zhǔn)的PCR程序通常包含以下步驟,您需要逐一設(shè)置:
(1)熱蓋溫度:
儀器會自動提示設(shè)置熱蓋溫度。為了防止液體蒸發(fā),請將其設(shè)置為 105°C。這是T100的推薦值,務(wù)必確保熱蓋緊密壓住管蓋。
注意: 如果您使用的是帶有熱蓋密封膜的96孔板,也需要將熱蓋溫度設(shè)為105°C。
(2)預(yù)變性:
這是高溫步驟,用于激活熱啟動酶并使模板DNA變性。
溫度: 94°C - 98°C (根據(jù)您使用的DNA聚合酶說明書推薦設(shè)置,常用 95°C)。
時間: 2 - 5分鐘。
(3)變性:
溫度: 94°C - 95°C
時間: 20 - 30秒
退火:
這是使用梯度功能的關(guān)鍵步驟!
設(shè)置梯度: 在設(shè)置退火溫度時,屏幕會提示您是否啟用梯度。選擇“Yes"或“Gradient"。然后您需要設(shè)置一個溫度范圍。
例如: 您想測試55°C到65°C之間的良好退火溫度。您可以設(shè)置 Gradient: 55 - 65°C。儀器會自動在樣品槽的不同列生成一個溫度梯度(例如,從左到右:55°C, 57°C, 59°C, 61°C, 63°C, 65°C)。
(4)最終延伸:
在所有循環(huán)結(jié)束后,進行一次充分的延伸,確保所有PCR產(chǎn)物都是全長的。
溫度: 72°C
時間: 5 - 10分鐘。
(5)最終保存:
反應(yīng)結(jié)束后,保持樣品在低溫以防止降解。溫度: 4°C 或 10°C
時間: 無限期(“Forever"),直到您取出樣品。
3、步驟3:設(shè)置循環(huán)數(shù)
在設(shè)置完所有溫度步驟后,系統(tǒng)會提示您設(shè)置第3步(循環(huán)擴增)的循環(huán)次數(shù),通常設(shè)為30-35個循環(huán)。
4、步驟4:命名和保存程序
程序設(shè)置完成后,系統(tǒng)會提示您為程序命名(例如,“Mouse_GeneX_Gradient")。
建議使用一個能清晰反映實驗內(nèi)容的名稱,然后選擇“Save"保存。這樣下次可以直接調(diào)用。
5、步驟5:運行程序
(1)放置樣品: 將蓋緊的PCR管或96孔板平穩(wěn)地放入儀器的樣品槽基座上。確保管蓋閉合。
(2)下拉熱蓋: 用力且平穩(wěn)地將儀器上方的熱蓋向下壓到底。您會感覺到明顯的阻力,這表明熱蓋已經(jīng)壓緊樣品管。
(3)開始運行: 在屏幕上確認程序信息無誤后,按下 “Start Run" 按鈕。
(4)運行監(jiān)控: 儀器開始運行,屏幕上會顯示當(dāng)前運行的步驟、剩余時間、當(dāng)前溫度等信息。您可以隨時監(jiān)控運行狀態(tài)。
二、伯樂T100梯度PCR運行后操作
1、運行結(jié)束: 當(dāng)程序運行完畢,儀器會發(fā)出蜂鳴聲提示,并顯示“Run Complete"。
2、取出樣品:
先抬起熱蓋! 小心地向上打開熱蓋。
戴上防燙手套或用鑷子取出PCR管/板,因為樣品槽可能還很熱。
立即將PCR產(chǎn)物置于冰上或轉(zhuǎn)移到4°C冰箱保存,以備后續(xù)的電泳或分析。
3、關(guān)閉儀器: 如果接下來沒有其他用戶使用,可以關(guān)閉電源。
三、重要注意事項與技巧
1、梯度PCR設(shè)計: 利用梯度功能可以快速優(yōu)化退火溫度。建議在預(yù)估良好退火溫度上下各設(shè)置5°C的范圍。
2、熱蓋是關(guān)鍵: 熱蓋未壓緊或溫度設(shè)置錯誤是導(dǎo)致實驗失敗的常見原因。務(wù)必確保熱蓋壓緊且溫度為105°C。
3、防止污染: 始終使用無菌的槍頭和試管,在干凈的區(qū)域配制反應(yīng)體系,以防止DNA污染導(dǎo)致假陽性。
4、程序驗證: 運行新程序時,可以不放樣品,空跑一個程序,觀察溫度變化是否正常,這被稱為“干運行"。
5、日常維護: 保持樣品槽的清潔。如果有液體灑出,請立即用70%乙醇擦拭干凈。