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技術(shù)文章

Thermo賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR技術(shù)參數(shù)使用說明書

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QuantStudio 3 是一款緊湊、經(jīng)濟的96孔板qPCR儀,非常適合常規(guī)的基因表達分析、病原體檢測和基因分型等應(yīng)用。其特點是操作簡便,軟件直觀。


一、賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR主要技術(shù)參數(shù)

尺寸(長寬高) 27 cm x 50 cm x 40 cm

重量 35 kg

溫度范圍 4-100°C

運行時間 <30min

通道 4個熒光通道

樣本體積 10-100 μL

變溫速率(模塊、樣本) 6.5°C/秒 3.66°C/秒

容量 1 x 96孔-0.1 ml

顯示器 8英寸彩色 TFT LCD 觸摸屏

激發(fā)檢測范圍 500-640 nm

產(chǎn)地 美國


關(guān)鍵參數(shù)解讀:

1、4通道:意味著一次運行最多可以同時檢測4個不同的靶基因(使用不同熒光染料標(biāo)記的探針)或者進行多色熔解曲線分析。

2、LED光源與CCD檢測:這種設(shè)計使其光學(xué)系統(tǒng)非常穩(wěn)定耐用,無需像鹵鎢燈那樣定期更換。

3、快速的升降溫速率:可以顯著縮短PCR循環(huán)時間,提高實驗效率。


二、賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR使用說明書

1、創(chuàng)建新實驗

在軟件主界面點擊 "New Experiment" (新建實驗)。

2、選擇實驗類型:

(1)Standard Curve (Absolute Quantification):定量,用于計算樣品中模板拷貝數(shù)。

(2)Comparative ΔΔCt (Quantitation):相對定量,用于分析基因的相對表達水平。

(3)Melt Curve:熔解曲線,用于鑒定PCR產(chǎn)物的特異性或進行基因分型。

(4)Genotyping:基因分型,專門用于等位基因判別。

3、設(shè)置實驗板:

(1)軟件會顯示一個虛擬的96孔板界面。

(2)用鼠標(biāo)選中孔位,在右側(cè)面板為其分配 "Sample Type" (樣品類型),如 Unknown, Standard, NTC等。

(3)為每個孔分配 "Target" (檢測目標(biāo)),例如 Gene A, Gene B, 內(nèi)參基因等。你需要先創(chuàng)建這些目標(biāo)。

(4)為每個"Target"選擇對應(yīng)的 "Dye" (熒光染料),如 FAM, VIC, ROX, CY5 等。


三、程序設(shè)置

點擊 "Protocol" 選項卡,設(shè)置PCR循環(huán)程序。一個典型的qPCR程序包括:

1、階段1:UNG酶孵育 (可選,防污染)

溫度:50°C

時間:2分鐘

2、階段2:預(yù)變性 (Hot Start)

溫度:95°C

時間:2-10分鐘 (根據(jù)酶的要求)

3、階段3:PCR循環(huán) (40-45個循環(huán))

變性:95°C, 15秒

退火/延伸:60°C, 1分鐘 (此步驟需根據(jù)引物Tm值優(yōu)化)

在此步驟末采集熒光信號 (對于SYBR Green等染料法)。

4、階段4:熔解曲線分析 (可選,用于SYBR Green實驗)

95°C, 15秒

60°C, 1分鐘

從60°C緩慢升溫到95°C (例如,0.05°C/秒),并持續(xù)采集熒光信號。


四、重要注意事項與維護

1、光學(xué)校準(zhǔn):建議定期(如每季度或更換實驗場所后)運行光學(xué)校準(zhǔn)程序,以確保所有熒光通道的檢測準(zhǔn)確性。

2、背景熒光校準(zhǔn):在創(chuàng)建實驗時,可以選擇運行"Background Calibration"(背景校準(zhǔn)),以消除板子和試劑的本底熒光。

3、ROX參比染料:根據(jù)你所使用的qPCR預(yù)混試劑類型,在設(shè)置"Dye"時,需要正確選擇是否需要ROX染料作為內(nèi)參,以及其濃度級別(如 Passive Reference ROX, ROX Low, ROX High)。

4、清潔維護:定期用柔軟的干布清潔儀器表面和樣品槽。如果發(fā)生污染,可用70%乙醇輕微濕潤的無絨布擦拭。

5、數(shù)據(jù)備份:定期備份實驗數(shù)據(jù)。

TEL:18016231680

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