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技術(shù)文章

Thermo賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR儀可以做哪些實驗?

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StepOnePlus是一款功能強大、應(yīng)用廣泛的入門級到中端qPCR儀。 它結(jié)合了可靠性、易用性和靈活性,能夠滿足絕大多數(shù)常規(guī)qPCR實驗的需求。


一、賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR可以做哪些實驗?

StepOnePlus的核心功能是實時熒光定量PCR,基于此,它可以完成以下幾大類實驗:

1、基因表達分析

這是qPCR常見的應(yīng)用。通過檢測特定基因的mRNA轉(zhuǎn)錄水平,來研究基因在何種條件下、何種組織中表達。

(1)定量: 使用標準品曲線,精確計算樣品中特定mRNA的拷貝數(shù)。適用于病毒載量、特定轉(zhuǎn)錄本豐度等需要絕對數(shù)值的研究。

(2)相對定量: 比較不同處理組(如藥物處理 vs 對照組、病變組織 vs 正常組織)之間目標基因表達的相對變化。通常使用ΔΔCt法,需要選擇合適的內(nèi)參基因(如GAPDH, β-actin)進行歸一化。

2、基因分型

利用qPCR的靈敏度和特異性,對DNA樣本進行快速、準確的基因型鑒定。

(1)SNP分型: 使用等位基因特異性探針(如TaqMan)來區(qū)分單核苷酸多態(tài)性。

(2)突變檢測: 檢測特定的基因突變,用于遺傳病篩查、癌癥研究等。

(3)轉(zhuǎn)基因鑒定: 快速鑒定動植物模型或樣品中是否含有轉(zhuǎn)基因成分。

3、微生物檢測與病原體定量

qPCR是微生物學(xué)和醫(yī)學(xué)診斷中工具。

(1)病毒載量檢測: 如HIV、HBV、HCV、HPV等病毒的定量檢測(用于科研,臨床診斷需在認證實驗室進行)。

(2)細菌/真菌檢測: 快速檢測和定量環(huán)境、食品或臨床樣品中的特定病原微生物。

(3)微生物負荷分析: 研究環(huán)境中微生物群落的組成和變化。

4、miRNA分析

microRNA是重要的基因表達調(diào)控因子。StepOnePlus配合特定的試劑盒(如TaqMan MicroRNA Assays)可以高靈敏度地檢測和定量這些小的RNA分子,用于癌癥研究、發(fā)育生物學(xué)等領(lǐng)域。

5、蛋白質(zhì)分析(間接)

通過免疫qPCR技術(shù),將抗體反應(yīng)與qPCR的放大能力相結(jié)合,實現(xiàn)超高靈敏度的蛋白質(zhì)檢測。雖然不直接檢測蛋白,但qPCR是該技術(shù)的關(guān)鍵組成部分。

6、染料法和探針法檢測

StepOnePlus支持兩種主流的qPCR化學(xué)方法:

(1)SYBR Green染料法: 經(jīng)濟、簡便,通過檢測雙鏈DNA的總量來定量。需要進行熔解曲線分析以確認擴增產(chǎn)物的特異性。

(2)TaqMan探針法: 特異性更高,適用于多重PCR(在StepOnePlus上通常為2-4重)和SNP分型。通過針對不同目標基因設(shè)計不同熒光標記的探針,可以在一個反應(yīng)管內(nèi)同時檢測多個目標。


二、賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR應(yīng)用在哪些領(lǐng)域?

1、基礎(chǔ)科學(xué)研究

(1)分子生物學(xué): 研究基因功能、信號通路、轉(zhuǎn)錄調(diào)控。

(2)細胞生物學(xué): 分析細胞分化、凋亡、應(yīng)激反應(yīng)等過程中的基因表達變化。

(3)發(fā)育生物學(xué): 研究胚胎發(fā)育不同階段的基因表達譜。

(4)神經(jīng)科學(xué): 分析腦組織中神經(jīng)遞質(zhì)、受體等相關(guān)基因的表達。

2、醫(yī)學(xué)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究

(1)癌癥研究: 檢測癌基因、抑癌基因的表達水平,用于腫瘤分型、預(yù)后判斷和藥物靶點研究。

(2)遺傳病研究: 進行攜帶者篩查、突變檢測和基因表達關(guān)聯(lián)分析。

(3)病原生物學(xué): 研究病原體的感染機制、宿主應(yīng)答以及抗病毒/抗菌藥物的效果評估。

(4)干細胞研究: 鑒定干細胞標志物,分析分化效率。

3、農(nóng)業(yè)與畜牧科學(xué)

(1)動植物育種: 進行分子標記輔助選擇,加快優(yōu)良品種的選育進程。

(2)轉(zhuǎn)基因生物檢測: 對農(nóng)產(chǎn)品進行轉(zhuǎn)基因成分的定性或定量檢測。

(3)疾病防控: 檢測畜禽、作物中的病原體,如病毒、植物病毒等。

4、食品安全與環(huán)境監(jiān)測

(1)食源性致病菌檢測: 快速篩查食品中的沙門氏菌、李斯特菌等。

(2)食品真?zhèn)舞b別: 檢測肉類、魚類等產(chǎn)品的物種來源,防止摻假。

(3)環(huán)境微生物監(jiān)測: 分析水體、土壤中的特定功能微生物或指示病原菌。


三、總結(jié)與特點

StepOnePlus的核心特點:

1、通量靈活: 提供96孔板和0.2mL單管兩種反應(yīng)模塊,適應(yīng)不同通量需求。

2、易于使用: 軟件界面直觀,實驗設(shè)置和數(shù)據(jù)分析流程化,非常適合實驗室常規(guī)使用和教學(xué)。

3、性能穩(wěn)定: 作為賽默飛旗下的經(jīng)典機型,其熱循環(huán)和光學(xué)檢測系統(tǒng)穩(wěn)定可靠,數(shù)據(jù)重復(fù)性好。

4、應(yīng)用全面: 覆蓋了從基因表達到基因分型的絕大多數(shù)qPCR應(yīng)用場景。

5、需要注意的是:

StepOnePlus是一款較經(jīng)典的型號,與新的高級qPCR儀(如QuantStudio系列)相比,其在升溫速度、多重檢測能力(顏色數(shù)量)、自動化整合等方面可能有所限制。

在進行臨床診斷應(yīng)用時,需要確保儀器、試劑和操作流程符合當(dāng)?shù)胤ㄒ?guī)和認證要求。

總而言之,賽默飛StepOnePlus是一款非常出色的“主力"qPCR儀,是眾多分子生物學(xué)實驗室的核心設(shè)備之一,其應(yīng)用范圍幾乎涵蓋了所有需要核酸定性和定量分析的科研與工業(yè)領(lǐng)域。

TEL:18016231680

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