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QuantStudio 3 在設(shè)計上能夠進行長時間的實驗,例如在運行標準96孔板時,一個典型的qPCR程序本身就需要1.5到2.5小時。儀器本身具備連續(xù)運行24小時甚至更久的硬件能力。
然而,能否順利實現(xiàn)24小時連續(xù)運行,關(guān)鍵在于實驗設(shè)計、樣品和試劑穩(wěn)定性以及無人值守的風險管理。以下是詳細的解釋和注意事項:
一、支持24小時運行的理由
1、硬件設(shè)計:儀器的加熱塊、光學檢測系統(tǒng)和控制軟件都支持長時間運行。您可以輕松設(shè)置一個循環(huán)數(shù)多、退火/延伸時間長的程序,總時長超過24小時。
2、軟件支持:QuantStudio Design and Analysis 軟件允許您設(shè)置并運行長達數(shù)天的實驗程序。
二、實現(xiàn)24小時連續(xù)運行的關(guān)鍵前提與注意事項
1、反應(yīng)體系蒸發(fā)問題(最關(guān)鍵!)
必須使用光學蓋膜或封板膜:不能直接使用普通的板蓋。需要使用專門的熱封膜(如 MicroAmp™ Optical Sealing Film)或光學透明的粘性封板膜,并用相應(yīng)的封板器將其緊密密封,防止在長時間高溫循環(huán)中液體蒸發(fā),導致反應(yīng)失敗和儀器污染。
驗證密封性:確保封膜沒有褶皺或未封緊的區(qū)域。
2、試劑和酶的穩(wěn)定性
使用長效酶:普通的Taq酶在長時間高溫循環(huán)下可能會失活。如果您計劃運行一個非常長的程序(例如超過3-4小時),強烈建議使用為“長片段PCR"或“長時間擴增"設(shè)計的特殊酶 mix,這些酶具有更好的熱穩(wěn)定性。
Mix的穩(wěn)定性:確保您使用的預(yù)混液(Master Mix)制造商沒有標明不適用于超長運行時間。
3、實驗設(shè)計的合理性
循環(huán)數(shù):通常40個循環(huán)已經(jīng)足夠檢測絕大多數(shù)模板。設(shè)置過高的循環(huán)數(shù)(如60-80循環(huán))不僅不必要,還可能增加背景噪音和蒸發(fā)風險。請根據(jù)您的模板濃度合理設(shè)置循環(huán)數(shù)。
程序步驟時間:延長退火/延伸時間會增加總運行時間。請確認您的擴增片段長度是否需要這么長的延伸時間。
4、無人值守的風險
電力保障:確保實驗室供電穩(wěn)定,有UPS(不間斷電源)支持,防止意外斷電導致實驗中斷和數(shù)據(jù)丟失。
儀器狀態(tài):在離開前,確認儀器運行正常,沒有報錯信息。
環(huán)境溫度:確保儀器周圍通風良好,環(huán)境溫度不會過高。
三、總結(jié)與建議
1、可以做到:QuantStudio 3 在技術(shù)上能夠單次連續(xù)運行24小時。
2、不推薦常規(guī)化:除非有特殊實驗需求(如使用特殊的長片段酶),否則不建議常規(guī)設(shè)計單次長達24小時的qPCR程序。更好的做法是優(yōu)化實驗方案,縮短運行時間,或采用分批上樣的間歇式運行。
3、如果必須進行:
嚴格密封:使用高質(zhì)量的光學密封膜和封板器。
選擇穩(wěn)定試劑:確認并使用熱穩(wěn)定性更高的酶。
進行預(yù)實驗:先用少量樣本進行一次長時間運行的預(yù)實驗,驗證擴增效率和結(jié)果是否可接受。
做好風險管理:確保電力穩(wěn)定,并告知實驗室相關(guān)人員。
4、總而言之,將QuantStudio 3用于24小時連續(xù)運行在技術(shù)上是可行的,但成功與否高度依賴于您對蒸發(fā)控制和試劑穩(wěn)定性的管理。 在嘗試之前,請務(wù)必仔細評估這些風險。